User Tools

Site Tools


bbiorefcode

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
bbiorefcode [2009/12/14 17:16]
miquel
bbiorefcode [2020/07/09 12:41] (current)
miquel
Line 1: Line 1:
 ====== Base de dades de metabolòmica BBIOREFCODE ====== ====== Base de dades de metabolòmica BBIOREFCODE ======
- 
-<note important> 
-A finals de 2009 hem rebut una nova versió de la base de dades. La instal·lació ha millorat moltíssim respecte la primera versió que vàrem rebre, tant que les instruccions següents ja no serveixen i s'hauran de substituir. Per ara només he afegit quatre notes breus a l'inici de la pàgina. 
-</note> 
  
 ===== Compra del BBIOREFCODE ===== ===== Compra del BBIOREFCODE =====
  
-L'any 2007 el SeRMN va sol·licitar un ajut per la compra d'un base de dades de metabonòmica a la convocatòria de [[http://www10.gencat.net/agaur_web/ | l’Agència de Gestió d’Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR)]] per a atorgar [[http://www10.gencat.net/agaur_web/AppJava/a_beca.jsp?categoria=recerca&id_beca=12321 | ajuts per a equipament i infraestructura destinats a la recerca (PEIR - DGR 2007)]]. La petició es va resoldre favorablement amb la concessió de l'ajut PEIR07-B-00010-50. L'any 2008 es va executar la compra a l'empresa Bruker Española, S.A., compra que va incloure,+L'any 2007 el SeRMN va sol·licitar un ajut per la compra d'un base de dades de metabonòmica a la convocatòria de [[http://www10.gencat.net/agaur_web/ | l’Agència de Gestió d’Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR)]] per a atorgar [[http://www10.gencat.net/agaur_web/AppJava/a_beca.jsp?categoria=recerca&id_beca=12321 | ajuts per a equipament i infraestructura destinats a la recerca (PEIR - DGR 2007)]]. La petició es va resoldre favorablement amb la [[http://www10.gencat.net/agaur_web/generados/catala/home/recurs/doc/res_peir07.pdf | concessió de l'ajut PEIR07-B-00010-50.]] L'any 2008 es va executar la compra a l'empresa Bruker Española, S.A., compra que va incloure,
   * la base de dades BBIOREFCODE 2-0-0   * la base de dades BBIOREFCODE 2-0-0
   * una llicència flotant del programa [[http://www.bruker-biospin.com/amix.html | Amix]], i   * una llicència flotant del programa [[http://www.bruker-biospin.com/amix.html | Amix]], i
   * una llicència del programa [[http://www.perchsolutions.com/products/PERCH%20Tools%20for%20BRUKER%a0Software.html | PERCH Tools for BRUKER Software.]]   * una llicència del programa [[http://www.perchsolutions.com/products/PERCH%20Tools%20for%20BRUKER%a0Software.html | PERCH Tools for BRUKER Software.]]
- 
-===== Instal·lació de la versió 2.0.1 - Novembre 2009 ===== 
- 
-  - Aquesta versió s'instal·la, com la resta de programari Bruker, a través d'un programa d'instal·lació amb interfície gràfica. 
-  - El DVD inclou una nova versió de l'AMIX, v. 3.0.2 
-  - Si es vol instal·lar la nova versió de l'AMIX al directori per defecte (''C:\Bruker\Aurelia-Amix''), cal desinstal·lar prèviament la versió que tinguem instal·lada, altrament el programa d'instal·lació donarà un missatge d'error. 
-    * A Windows-XP, la versió d'AMIX instal·lada es pot eliminar a través de l'eina //Afegeix o suprimeix programes// disponible al //Tauler de Control.// 
-    * Un cop desinstal·lat l'AMIX, a la seva carpeta queden fitxers i carpetes relacionats amb el PERCH que no afecten la instal·lació de la nova versió de l'AMIX. 
-  - El DVD inclou una nova versió de la base de dades BBiorefcode, agrupada en tres parts: 
-    * la primera part correspon a la versió anterior 2.0.0, i 
-    * les parts 2 i 3 contenen nous compostos. 
-  - La base de dades Biorefcode s'instal·la per defecte al directori ''C:\Bruker\bbiorefcode''. Tot i que és possible canviar-ho, el programa d'instal·lació només aplica el canvi de directori a la primera part de la base de dades, mentre que les ampliacions de la base de dades (parts 2 i 3) es continuen instal·lant al directori per defecte. Així doncs, **la recomanació és no modificar el directori d'instal·lació del Biorefcode.** 
-  - El programa d'instal·lació comprova si el Firewall de Windows-XP està en funcionament i si cal configurar-ho. En cas de necessitat, demana si es vol configurar. Hores d'ara **la recomanació és respondre que no,** ja que el fitxer de configuració no hi és al DVD i l'intent de fer-ho servir es tradueix en un missatge d'error al final de la instal·lació. 
-  - A l'ordinador de metabolòmica la instal·lació s'ha completat ràpidament i satisfactòria, i l'AMIX ha importat el contingut de la nova versió del BBiorefcode sense problemes (sayonara //import tool// 8-)) i només ha donat un missatge d'error del FlexLM perquè cal demanar una nova llicència: BBIOREFCODE-2-0-1 ≠ BBIOREFCODE-2-0-0. 
- 
-{{:metabonomica:bbiorefcode-2-0-1_install_1.png?300|Instal·lació completada correctament}}{{:metabonomica:bbiorefcode-2-0-1_install_2.png?200|Aquest missatge d'error es pot ignorar}}{{:metabonomica:bbiorefcode-2-0-1_install_3.png?400|Cal demanar una nova llicència}} 
- 
-Aquestes notes les hi faré arribar a en Christian Fischer per tal que corregeixin aquests errors a la propera versió. 
- 
  
 ===== BBIOREFCODE 2-0-0 ===== ===== BBIOREFCODE 2-0-0 =====
Line 259: Line 236:
 | betaine | methanethiol |   | | betaine | methanethiol |   |
  
 +==== Actualització a la versió 2.0.1 ====
 +
 +El novembre de 2009 la base de dades es va actualitzar a la versió 2.0.1, que incorpora les següents millores:
 +  - Instal·lació gràfica de la base de dades i programes auxiliars.
 +  - Nova versió del programa AMIX (v. 3.0.2) que millora el processament d'espectres 2D.
 +  - Addició d'uns 50 nous compostos.
  
 ===== AMIX ===== ===== AMIX =====
Line 268: Line 251:
 Al lloc web de l'empresa desenvolupadora trobareu una [[http://www.perchsolutions.com/products/PERCH%20Tools%20for%20BRUKER%a0Software.html | descripció breu del programa]] i unes senzilles [[http://www.perchsolutions.com/Downloads/install.html | instruccions d'instal·lació]] on s'explica com obtenir la llicència d'ús del programa. Al lloc web de l'empresa desenvolupadora trobareu una [[http://www.perchsolutions.com/products/PERCH%20Tools%20for%20BRUKER%a0Software.html | descripció breu del programa]] i unes senzilles [[http://www.perchsolutions.com/Downloads/install.html | instruccions d'instal·lació]] on s'explica com obtenir la llicència d'ús del programa.
  
-<note important>+<WRAP important>
 Aquest programa només està disponible per Windows i la llicència només és vàlida per l'ordinador en que s'instal·la. Aquest programa només està disponible per Windows i la llicència només és vàlida per l'ordinador en que s'instal·la.
-</note>+</WRAP>
  
 Sortosament, hi ha una versió gratuïta "The LITE-Edition covering most of the features of previous version is now FREEWARE for academic users." Per més informació consulta [[http://www.perchsolutions.com/sales/sales.html | la pàgina de vendes]] o la pàgina que compara les [[http://www.perchsolutions.com/sales/licenses.html | característiques de les versions disponibles.]] Sortosament, hi ha una versió gratuïta "The LITE-Edition covering most of the features of previous version is now FREEWARE for academic users." Per més informació consulta [[http://www.perchsolutions.com/sales/sales.html | la pàgina de vendes]] o la pàgina que compara les [[http://www.perchsolutions.com/sales/licenses.html | característiques de les versions disponibles.]]
bbiorefcode.1260807392.txt.gz · Last modified: 2009/12/14 17:16 by miquel