User Tools

Site Tools


bbiorefcode

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
Last revision Both sides next revision
bbiorefcode [2009/05/28 11:43]
miquel
bbiorefcode [2011/09/09 12:38]
miquel [Compra del BBIOREFCODE]
Line 1: Line 1:
-====== Base de dades de metabolòmica BBIOREFCODE 2-0-0 ======+====== Base de dades de metabolòmica BBIOREFCODE ======
  
-L'any 2007 el SeRMN va sol·licitar un ajut per la compra d'un base de dades de metabonòmica a la convocatòria de [[http://www10.gencat.net/agaur_web/ | l’Agència de Gestió d’Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR)]] per a atorgar [[http://www10.gencat.net/agaur_web/AppJava/a_beca.jsp?categoria=recerca&id_beca=12321 | ajuts per a equipament i infraestructura destinats a la recerca (PEIR - DGR 2007)]]. La petició es va resoldre favorablement amb la concessió de l'ajut PEIR07-B-00010-50. L'any 2008 es va executar la compra a l'empresa Bruker Española, S.A., compra que va incloure,+ 
 +===== Compra del BBIOREFCODE ===== 
 + 
 +L'any 2007 el SeRMN va sol·licitar un ajut per la compra d'un base de dades de metabonòmica a la convocatòria de [[http://www10.gencat.net/agaur_web/ | l’Agència de Gestió d’Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR)]] per a atorgar [[http://www10.gencat.net/agaur_web/AppJava/a_beca.jsp?categoria=recerca&id_beca=12321 | ajuts per a equipament i infraestructura destinats a la recerca (PEIR - DGR 2007)]]. La petició es va resoldre favorablement amb la [[http://www10.gencat.net/agaur_web/generados/catala/home/recurs/doc/res_peir07.pdf | concessió de l'ajut PEIR07-B-00010-50.]] L'any 2008 es va executar la compra a l'empresa Bruker Española, S.A., compra que va incloure,
   * la base de dades BBIOREFCODE 2-0-0   * la base de dades BBIOREFCODE 2-0-0
   * una llicència flotant del programa [[http://www.bruker-biospin.com/amix.html | Amix]], i   * una llicència flotant del programa [[http://www.bruker-biospin.com/amix.html | Amix]], i
   * una llicència del programa [[http://www.perchsolutions.com/products/PERCH%20Tools%20for%20BRUKER%a0Software.html | PERCH Tools for BRUKER Software.]]   * una llicència del programa [[http://www.perchsolutions.com/products/PERCH%20Tools%20for%20BRUKER%a0Software.html | PERCH Tools for BRUKER Software.]]
  
-<note warning> +
-He demanat a Bruker Española, S.A. que ens indiqui una persona de suport tècnic a qui adreçar els dubtes que tenim actualment. +
-</note>+
  
 ===== BBIOREFCODE 2-0-0 ===== ===== BBIOREFCODE 2-0-0 =====
- 
-<note important> 
-El CD-R no venia amb cap manual d'instruccions per instal·lar-ho, potser les instruccions estiguin al manual de l'Amix, però per comprovar-ho caldrà instal·lar el programa i comprovar-ho o esperar a saber qui ens pot donar suport tècnic. 
-</note> 
  
 A principis de 2009 vàrem rebre un CD-R amb la base de dades BBIOREFCODE, composada per les dades espectroscòpiques de rmn 1D i 2D de 500 metabòlits. El CD-R contenia un únic fitxer, aparentment en format TAR, que després de nombrosos intents, només es va poder obrir amb el programa [[http://www.winzip.com/ | WinZip]], cosa que ens fa pensar que es tracta d'una versió no estàndard de fitxer TAR. A principis de 2009 vàrem rebre un CD-R amb la base de dades BBIOREFCODE, composada per les dades espectroscòpiques de rmn 1D i 2D de 500 metabòlits. El CD-R contenia un únic fitxer, aparentment en format TAR, que després de nombrosos intents, només es va poder obrir amb el programa [[http://www.winzip.com/ | WinZip]], cosa que ens fa pensar que es tracta d'una versió no estàndard de fitxer TAR.
 +
 +Per altra banda, el CD-R no venia amb cap manual d'instruccions per instal·lar-ho. Les instruccions per importar bases de dades es troben al manual de l'Amix, //Chapter 14, Spectra bases.//
  
 ==== CD-R disponibles ==== ==== CD-R disponibles ====
Line 240: Line 239:
 | betaine | methanethiol |   | | betaine | methanethiol |   |
  
 +==== Actualització a la versió 2.0.1 ====
 +
 +El novembre de 2009 la base de dades es va actualitzar a la versió 2.0.1, que incorpora les següents millores:
 +  - Instal·lació gràfica de la base de dades i programes auxiliars.
 +  - Nova versió del programa AMIX (v. 3.0.2) que millora el processament d'espectres 2D.
 +  - Addició d'uns 50 nous compostos.
  
 ===== AMIX ===== ===== AMIX =====
bbiorefcode.txt · Last modified: 2020/07/09 12:41 by miquel